全基因组Survey

产品介绍常见问题结果展示


基因组Survey:专业,卓效。

基因组Survey基于小片段文库的低深度测序数据,通过K-mer分析,从而有效的评估基因组大小、
GC含量、杂合度以及重复序列含量等信息,是全面了解某一物种基因组特征的有效方法,
为后续的全基因组de novo 测序组装策略的制定提供理论依据。

方法优,周期短,准确度高。

基于K-mer分析,可快速确定基因组特征,该方法已广泛应用于
评估基因组基本特征。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
通过K-mer分析,预估物种基因组大小,并对物种基因组,
重复序列情况进行分析。对基因组进行初步组装,进行GC含量和
外源污染分析。同时,基于初步组装的版本,可以进行SSR
标记开发和同源注释。

基因组Survey 分析内容
标准分析 基因组大小评估
杂合度评估
重复率评估
初步组装
GC含量评估
高级分析 SSR标记开发
同源注释

出色分析,铸就完美结果。

测序深度为50X,基于小片段数据,通过K-mer分析可以有效评估基因组大小、
GC含量、杂合度以及重复序列含量等信息,除此之外还可以对数据进行初步组装、
SSR标记的开发以及同源注释。

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

基因组Survey采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

诺禾致源已经成功对鸟类、哺乳动物、水产动物、经济作物、兰科植物、
中草药等进行基因组特征评估,结合丰富的项目经验,专业的项目方案指导和分析流程,
保证快速、准确的评估基因组特征。

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