circRNA测序

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勇攀circRNA研究巅峰

环状RNA(circular RNA, circRNA)是一类特殊的非编码RNA分析,
测序采用Illumina HiSeq 4000平台进行测序,针对有参考基因组样本开展准确的circRNA鉴定
以及来源基因的分析,环状RNA测序在医学、农学研究领域应用越来越广泛。

平台优,周期短,性价比高。

基于高通量测序,依据主流数据库和circRNA鉴定软件,
分析项目物种的circRNA信息,深入挖掘circRNA在转录调控中所发挥的重要功能。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

诺禾致源circRNA测序项目,通过高效富集circRNA,借助最主流软
件对circRNA进行鉴定,并通过分析来源基因,以深化对项目物种
circRNA的功能研究。

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分析内容 解决问题
参考序列比对 分析测序reads比对率和覆盖度
circRNA鉴定 发现样本中存在的circRNA
circRNA来源基因分析 有助于明确哪些基因能够形成circRNA
circRNA表达水平定量 circRNA在各个样本中的表达水平
差异表达分析 样本之间差异表达的circRNA
GO、KEGG富集分析 明确来源基因的具体生物学功能
miRNA结合位点预测 circRNA发挥海绵效应的基础

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

环状RNA测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2015年12月,诺禾致源已经成功对人、鼠、羊、猪、鸡、斑马鱼、果蝇、
家蚕、蜜蜂、线虫、拟南芥、油菜、水稻、棉花、稻瘟菌等30多个物种进行circRNA测序分析,
做为一种相对较新的RNA测序产品,circRNA广受关注,大量研究成果发表在权威期刊。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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