全基因组关联分析

产品介绍常见问题经典案例结果展示


材料广,变异多,定位全。

基于全基因组重测序的关联分析,快速准确地实现多个目标性状基因的高效定位,
具有“材料来源广、遗传变异多、性状定位全”的优势,已广泛应用于水稻、牛、疟原虫、
彩虹鳟鱼以及毛果杨等物种。

一次实验,实现多性状定位。

全基因组关联分析是对具有遗传多样性丰富的群体的每个个体进行全基因组重测序,
结合目标性状的表型数据,基于一定的统计方法进行全基因组关联分析,
可以快速获得影响目标性状表型变异的染色体区段或基因位点。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

全基因组关联分析首先进行群体分层,分析了解材料的分层信息;然后
进行连锁不平衡分析,连锁不平衡的水平可决定关联分析的精度、所选
标记的数目;最后结合群体基因型和表型数据,使用基于混合线性模型
进行全基因组关联分析,对分析所得的与目标性状强关联的位点进行基
因功能注释。

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全基因组 简化基因组(GBS)
1. 已有参考基因组序列的动植物自然群体;
2. 样本间无明显的亚群分化(如生殖隔离等);
3. 所研究表型性状遗传力较强。
≥300个样本
基于SNP:≥10 X/个体
基于CNV:≥30X/个体
10~20W Tags
平均8 X/Tag
测序数据质量评估
与参考基因组比对
SNP、CNV检测及注释 SNP检测及注释
构建系统进化树
群体主成分分析
连锁不平衡分析
性状关联分析
目标性状相关区域基因功能注释
构建单体型图谱
构建系统进化树
群体主成分分析
性状关联分析
目标性状相关区域基因功能注释

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

全基因组关联分析采用先进的HiSeq PE150测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

诺禾致源已经成功对水产、林木、经济作物、动物等十几个物种进行目标性状定位,
结合丰富的项目经验,专业的项目方案指导和分析流程,保证项目准确并且快速地进行。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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