Hi-C测序

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前沿技术带你走进DNA的三维空间

Hi-C技术是染色体构象捕获(Chromosome conformation capture,简称为3C)
的一种衍生技术,是指基于高通量进行染色体构象的捕获,
它能够在全基因组范围内捕捉不同基因座位之间的空间交互信息,
研究三维空间中调控基因的DNA元件。

高通量染色体构象捕获技术

Hi-C技术是高通量染色体构象捕获技术
(High-throughput chromosome conformation capture)。
利用高通量测序技术,结合生物信息学分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA
在空间位置上的关系,构建染色体跨度单体型,同时捕获不同基因座位上之间的空间交互信息,
获得高分辨率的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
构建染色体跨度单体型,基于全基因组的互作信息,获得高分辨率
的染色质三维结构信息,并能开发调控基因的DNA元件。
此外,还可结合转录组,重测序和ChIP-seq数据进行联合分析,从碱基变化、
基因表达、蛋白修饰及染色体三维构象分析等多方面深入探讨生物学问题。

构建染色体跨度单体型 三维结构重构以及调控元件开发
测序质量评估
Hi-C数据质控比对统计
插入片段统计
NT库比对
比对参考基因组 比对及过滤
SNP检测与注释 互作图谱构建
InDel检测与注释 TAD分析
基因组杂合度统计 三维结构重构
染色体跨度单体型构建 调控元件的开发

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

Hi-C技术采用先进的HiSeq PE150平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

出色完成每一个项目环节

至2017年12月,已经成功实现人、小鼠、大鼠、禽类、哺乳动物、鱼类、贝类、微生物类
(真菌和原核生物)、拟南芥、水稻、玉米、大豆、棉花、小麦、油菜、花生、果树、林木、蔬菜等多种动植物的Hi-C测序和分析。
多样化的样本类型均可成功进行Hi-C文库构建,同时先进完善的实验流程和测序平台,保证优质的有效数据。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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