宏基因组测序

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环境微生物研究,一站式解决

宏基因组学(Metagenomics),又称元基因组学,
是以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,无需分离培养,直接提取环境样本DNA进行测序,
研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能及代谢网络等,已广泛应用于微生物领域。

周期短,通量高,信息全。

诺禾致源宏基因组研究采用先进的Illumina HiSeq 4000平台,结合样品特点
和数据的产出,选取最优组装效果,充分挖掘环境样品中的微生物菌群和功能基因。
具有“周期短、通量高、信息全”的优势,已广泛应用于土壤、海洋等研究中。

科学方案设计

从材料选取,建库测序,到数据分析,
每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

信息分析

分析内容=标准分析+高级分析。
以特定生境中的整个微生物群落作为研究对象,直接提取环境样本
DNA,采用新一代测序技术,获得环境微生物基因信息总和。

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分析内容 解决问题
测序数据质量评估 过滤掉低质量数据,保证数据质量
基因预测 基因预测及相关性分析
物种、功能注释 物种、基因功能注释及相关分析
CARD 耐药基因相关分析
CAG/MLG分析 疾病和菌株关联研究
CNV(copy number variation) 菌株拷贝数变异与疾病关联研究
噬菌体 噬菌体及前噬菌体预测及分析

悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

宏基因组测序采用先进的HiSeq 4000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

项目经验丰富

至2017年12月,诺禾致源宏基因组样本数突破3700例,
包括土壤、水体、粪便、淤泥等样本。
“科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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